冬瓜籽可以像瓜子一样炒着吃，按照炒瓜子的步骤就可以炒制冬瓜籽，刚出锅的冬瓜籽有一股焦香味，又香又脆。
冬瓜籽可做药用。冬瓜籽可以润肺，可以化痰，可以清热，也可以除湿，有利于消肿利尿，也可以治疗痰热咳嗽、气管炎等症。